中药室是我所最早成立的主要检验科室之一，现有高级职称5名、中级职称1名、初级职称3名；博士1人、在读硕士研究生1人、其余均为本科生；具有执业药师资格人员4名；具有司法鉴定资格人员2名。中药室先后多次获得所、局级先进集体称号，多人多次获得所、局级先进个人、优秀共产党员称号。
      中药室的主要业务范围包括：1、承担中成药、中药材和饮片的监督检验、委托检验、注册检验工作。2、承担省内中成药和中药材注册质量标准的技术复核及企业委托的质量标准的起草工作。3、承担由国家食品药品监督管理局和国家药典会下达的新版药典等国家标准中中成药和中药材新增、修订品种质量标准的起草和复核工作。4、承担由国家药典委员会、中国药品生物制品检定所和省食品药品监督管理局下达的各项有关中成药和中药材的科研课题。5、指导代培各类进修人员等。

      建所初期，由于受客观条件的制约，中药室仪器设备贫乏，检验技术落后，只能开展“性状”、“检查”等简单的检验项目。进入上世纪80-90年代，随着仪器设备的不断增加，人员不断充实，检验手段相应提高，检验项目逐步增加。2000年至今是中药室发展较快的时期，不论从仪器设备到检品数量和检验项目，都有了长足的发展。目前配备有大型仪器近10余台，包括高效液相色谱仪3台、薄层色谱扫描仪、薄层摄影仪、紫外分光光度计、高速离心机、数码摄影显微镜、数码成像系统、二极管阵列检测器等。检品数量也从几十件发展到现今每年千余件。随着中药质量标准指标的不断增加和完善，中药室能够开展的中药检验项目逐年增加，现已有60多项通过国家实验室认可。中药标本室是中药室的特色之一，始建于60年代，现有药材标本和伪劣样品1000余种，2300多份、根据这些收集的药材资源，曾参与《青海中药资源普查资料》《青海中药炮制规范》《青海省地方药品标准》等的起草、修订、复核和编撰工作；指导代培各类进修人员等。

       中药室注重技术水平和科研能力的提高，积极争取和参与科研课题,承担了国家药典委员会、中国药品生物制品检定所、省科技厅、省科协、省卫生厅等部门的多项科研项目，承担国家药典等国家标准中部分新增及修订质量标准的起草、修订、注册复核任务；积极开展青藏高原中藏药开发利用研究，完成中藏药质量标准研究100多项；主持完成省重大科技攻关招标项目《青海道地药材冬虫夏草指纹图谱研究”》课题，鉴定委员会专家认为达到国内领先、国际先进的技术水平（尚在评奖之中）。近十年来修订、复核中成药地标升国标品种及试行转正标准180余个；起草、复核国家药品标准提高行动计划任务品种41个；正在承担2010版中国药典起草复核任务23个。业余时间全室人员以药品质量控制和质量分析技术为主要内容开展科研工作，参与《中国药典》及其配套丛书、《中国民族药志》《青海省药品标准》《青海省藏药标准》《青海省中药炮制规范》、《青海省医疗机构制剂规范》等30部书籍的起草、修订、复核和编撰。历年来荣获省政府、省科协、省卫生厅等部门科技成果奖20多项，发表学术论文200多篇，分别发表在国际国内专业期刊上，获优秀论文奖多篇。在所统一安排下，本室多人次曾去先进单位进修学习，从而不断提高了队伍整体素质。

        经过半个世纪的发展，中药室已成为具有省内一流检验能力的科室，是我省从事中药和天然药物检测的主要部门，是一支具有较丰富中药检测经验的团队，可以进行中药及其制剂、天然药物的常规检验和各种法定检验；可以进行中药和天然药物中非法添加化学药品的检测；可开展药品检验方法、质量标准、药品质量以及与药品有关的药品安全性、有效性等方面的科研工作；承担中药标本的制作及管理工作；具有一定的中药、天然药物研究开发能力。目前正以国内先进实验室为目标，努力提升自身水平，锐意进取、开拓创新，为中藏药现代化和保障人民安全用药、促进民族经济繁荣做出应有的贡献。